Kirknek és Spocknak a múltba kell utazniuk, hogy kijavítsák a történelmet megváltoztató eseményt.

Kirk egy bányászbolygón történt szörnyű gyilkosságsorozat után nyomoz, amelyek egy ellenségesnek tűnő idegen lény műve.

Az Enterprise megérkezik egy bolygóra, hogy diplomáciai kapcsolatokat létesítsen, és egy “békés” háború kellős közepén találja magát, amely a hajó elpusztításával fenyeget.

Az Enterprise találkozik egy békésnek tűnő civilizációval, amelyet egy Landru nevű “jóindulatú” lény irányít… aki azt akarja, hogy csatlakozzanak a népéhez.

Amikor egy titokzatos idegen faj elpusztít egy földi kolóniát, az Enterprise üldözi, de Kirket és a másik kapitányt erős idegenek arra kényszerítik hogy megküzdjenek egymással.