Az Enterprise legénysége egy békés, lelkipásztori bolygóra távozik… ahol álmaik és fantáziáik életre kelnek.

Kirk szembeállítja az Enterprise-t egy láthatatlan űrhajóval, amely a szövetség védelmét teszteli.

Kirk az egyik utolsó túlélő, aki képes azonosítani egy tömeggyilkost, aki egy Shakespeare-csoport között lapul az Enterprise fedélzetén.

Spock bírósági tárgyalása folytatódik, miközben megpróbálja igazolni Pike elrablását, az Enterprise ellopását, és a Csillagflotta által betiltott bolygó felé tartott.

Spock elrabolja korábbi kapitányát, a nyomorék Christopher Pike-ot, és egy karanténba zárt bolygó felé veszi az irányt, kockára téve karrierjét és Kirk életét.

Az Enterprise egy hatalmas idegen hajóval találkozik, amely megpróbálja őket tesztelni.

Kirk egy kísérleti létesítményt vizsgál, ahol foglyokat tartanak, és baljós tervet talál.

Kirk és egy leszállócsapat egy bolygón rekednek egy olyan betegség miatt, amely minden felnőttnek fájdalmas halált okoz, és meg kell küzdeniük a túlélő helyi gyerekekkel.

Christine Chapel nővér újra találkozik régi vőlegényével az Exo III-on, de a tudósnak tervei vannak Kirk kapitánnyal és a Föderációval.

Az Enterprise felvesz egy intergalaktikus ördögöt, Harry Muddot és három hihetetlenül gyönyörű nőt, akik egy sötét titkot rejtenek magukban.

A transzporter meghibásodása miatt Kirk kapitány „jó” és „gonosz” énjére szakad, és a leszállócsapat halálra fagy, ha nem egyesítik újra a kettőt.

Egy furcsa idegen anyag hatására a legénység kifejti legmélyebb gátlásait, miközben a hajó lezuhan a pályáról.

A galaxis peremének felfedezése közben az Enterprise energiagáttal találkozik, amely a legénység két tagját isteni erővel ruházza fel.

Kirk kapitánynak meg kell találnia egy 17 éves fiú erejének korlátait, aki képes bármit létrehozni és elpusztítani.

Kirket és legénységét halálos veszély fenyegeti egy idegen lény miatt, amely az emberi testben lévő sóval táplálkozik, és bármilyen formát ölthet.